L'ambientazione dove si svolgono le vicende di Chrono Crusade è Brooklyn, New York negli anni ‘20, i cosiddetti "anni ruggenti", tra jazz, alcol e mafia nelle strade, fu un periodo storico di prosperità in cui però la distinzione sociale crebbe sempre di più, tirando fuori da ogni individuo il peggio della propria anima. Qui entra in gioco l'Ordine della Maddalena, organizzazione nata con lo scopo di combattere i demoni e le creature dell'oscurità. I suoi componenti giurano di proteggere i sette "Apostoli" ovvero esseri umani con poteri soprannaturali in grado di richiamare il condotto astrale, fonte di ogni essere vivente, e poterne sfruttare il potere.