Il caso fa sì che i percorsi di Shaggy e del cane Scooby-Doo si incontrino per la prima volta. Da quel momento indivisibili, formano con i giovani detective Fred, Velma e Daphne, la mitica Mystery Inc, con cui risolveranno numerosi casi tra cui quello più complicato di tutti: il complotto teso a scatenare le furie del cane fantasma Cerberus e provocare un disastro senza precedenti. Sarà così che il gruppo scoprirà un segreto legato a Scooby e al suo epico destino....